Wbrew zapowiedziom likwidacji Funduszu Kościelnego ten znalazł się w budżecie na przyszły rok. I to na rekordowo wysokim poziomie 257 mln złotych. Ten zapis (tak jak o mediach publicznych) wywołał kontrowersje. Minister finansów Andrzej Domański tłumaczył w TVN24, że na jego usunięcie nie było zgody w koalicji. Premier Donald Tusk uspokajał, że Funduszem Kościelnym rząd zajmie się na pierwszym poświątecznym posiedzeniu. "Gazeta Wyborcza" dowiedziała się, jaki plan ma Donald Tusk.
Premier chciałby wrócić do propozycji z czasów rządów PO-PSL, która ostatecznie nie została zrealizowana. Wtedy rząd chciał zlikwidować Fundusz Kościelny, a zamiast niego wprowadzić dobrowolny odpis podatkowy na kościoły w wysokości 0,3 proc. Kościół domagał się wtedy 1 proc. i ostatecznie temat upadł. "Jak się dowiadujemy - teraz, a dokładnie w 2025 r., nowy rząd chce do tego pomysłu wrócić" - czytamy w "Gazecie Wyborczą".
Według informacji "GW" takie rozwiązanie mogłoby udobruchać zwłaszcza PSL, który jest głównym przeciwnikiem likwidacji Funduszu Kościelnego, ale "jeśli mieliby zaakceptować zmiany, domagają się przyjaznego rozdziału Kościoła od państwa". Nowemu rządowi być może łatwiej będzie się dogadać z konserwatywną Konfederacją. W marcu w rozmowie z Interią Sławomir Mentzen mówił, że "Fundusz Kościelny jest odszkodowaniem za ziemię i nieruchomości, które państwo Kościołowi zabrało. Gdyby oddać te nieruchomości, to wtedy można ten fundusz zlikwidować". Dlatego można zakładać, że Platforma Obywatelska znalazłaby poparcie w likwidacji funduszu poza rządową koalicją.
Przypomnijmy, że Fundusz Kościelnym został powołany w 1950 roku jako forma rekompensaty dla kościołów za przejęte przez państwo nieruchomości ziemskie. Sam Kościół twierdzi, że strat nadal nie zrekompensowano. Po 1989 roku Fundusz Kościelny zmienił swoją funkcję. Obecnie m.in. opłaca ubezpieczenie zdrowotne i społeczne duchownych wyznań zarejestrowanych w Polsce.
Obecnie z Funduszu Kościelnego można również uzyskać pieniądze na remonty obiektów sakralnych oraz działalność charytatywno-opiekuńczą. W bieżącym roku maksymalna kwota udzielonej dotacji z Funduszu Kościelnego w roku 2023 wynosiła 200 000 zł, ale uwzględniając "ważny interes społeczny" Minister Spraw Wewnętrznych i Administracji może zwiększyć jej wysokość. W ubiegłym roku na te cele wydano łącznie 11,1 mln zł.